近年來，南京醫科大學堅持把科技創新擺在重要位置，以“四個面向”為根本遵循，聚焦重大民生問題，加大對基礎問題與關鍵問題的科研攻堅力度，努力實現高水平科技自立自強，讓創新成為學校高質量發展的強大引擎。

學校圍繞國家重大戰略需求，加快科技自立自強步伐，推進關鍵核心技術攻關，取得了一系列開創性研究成果。堅持以全球視野謀劃推動科技創新，搶占基礎研究制高點，促進基礎與應用相結合，圍繞重大前瞻性醫學問題和行業產業“卡脖子”技術問題，在多個領域實現并跑、領跑。

學校堅持“破五唯”，建立了以品德和能力為導向的人才評價體系，構建支持全面創新的教育生態。大力推動校院、校地、校企合作，重視學科交叉融合創新，以科技工作支撐學科建設，反哺人才培養，點燃高質量發展新引擎。積極推動醫教協同、科教融合，著重培養創新型、復合型、應用型人才，激發師生邁向科技創新之路、投身服務百姓健康的內在動力。

學校科技工作者以科技創新引領衛生健康事業高質量發展，守護人民健康。“心佑工程”團隊赴新疆、青海、西藏、貴州、陜西、安徽等地，對家境貧困的先心病患兒免費開展救治，獲批教育部“全國省屬高校精準扶貧精準脫貧典型項目”。新冠肺炎疫情發生以來，學校附屬醫院派出600余名醫護人員馳援武漢。依托公共衛生與預防醫學A+學科優勢，整合多學科力量，在病例研究、抗體研發、預測模型、臨床手術等方面貢獻南醫智慧，打出南醫科技抗疫的組合拳。