河海大學注重優化調整學科布局，整合相關傳統學科資源，促進學科交叉融合，構建以水利為特色，工科為主、多學科協調發展的學科生態體系，為推進世界一流大學建設奠定堅實基礎。

推動分層分類建設，學科布局顯著優化。持續推進學科建設行動計劃，注重分層建設、分類指導、重點突破，構建并完善國家級、省級、校級三級學科建設體系。目前，學校擁有42個一級學科，擁有“雙一流”建設學科2個、江蘇高校優勢學科建設工程三期項目立項學科6個，“十四五”江蘇省重點學科10個。

強化一流學科引領，學科交叉快速發展。深入推進以“水”為核心的學科交叉與協同創新，充分發揮一流學科輻射帶動作用，提高科技創新成果的產出與轉化。服務水利行業重大應用需求，設置人工智能交叉學科，開展“人工智能+智慧水利”交叉研究；圍繞“碳達峰、碳中和”國家發展戰略，設置新能源科學與工程交叉學科，重點研究風能、太陽能、海洋能和綜合能源利用等方向關鍵技術。快速發展的交叉學科，為學校在前沿領域培育新的學科增長點奠定了良好基礎。

匯聚學科優勢資源，平臺建設成效顯著。緊密圍繞學科前沿和行業需求，重視科研平臺建設。成立水科學研究院，以國家重點實驗室、國家工程研究中心、國際合作聯合實驗室等重大平臺建設為基礎，打造水科學、水工程、水環境及水生態等高質量創新基地，解決行業“卡脖子”問題能力持續提升。

創新學科發展機制，學科活力全面激發。全面落實深化新時代教育評價改革要求，推行“項目制、考核評價、資源配置”三項舉措，建設成效不斷提升。瞄準重大平臺、高層次團隊、重大項目等內容，規劃形成項目清單，以項目凝聚人才、平臺等建設要素，培養一流人才、產出一流成果、主動服務國家需求。構建學科建設成效評價體系，對全校學科進行分層分類考核，重點考核學科影響力、重點工程建設等標志性建設成效。發展機制改革全面激發了學科建設活力，為學校“雙一流”建設提供源源不斷的內生動力。